近日,中国科学技术大学科研团队成功研发出开源RNA序列基础模型structRFM,在RNA结构预测与功能推断等多项下游任务中表现卓越,为AI在科学研究、生物学机制探索及药物研发等领域提供有力支持。5日,该成果在国际权威学术期刊《自然》发表。
RNA是重要生物大分子,存在于生物细胞及部分病毒、类病毒中,广泛参与蛋白质合成等生命过程,其功能与序列、折叠结构密切相关;理解序列、结构与功能之间的联系,是揭示RNA生物学机制的重要基础,也是药物发现支撑要素。随着测序技术发展,研究者积累了海量RNA序列数据;借鉴自然语言处理预训练方法,RNA基础模型能从数据中学习序列规律、提取通用特征,为结构预测和功能分析提供支持。
中科大团队构建的structRFM经预训练后,仅需输入序列信息,即可有效提取序列层次、核苷酸层次及核苷酸对层次特征,适用于多种结构与功能预测任务,相关表现达国际领先水平。研究团队表示,已公开完整匹配数据、模型参数和原始代码等全部资料,有助于研究者重现结果及开发相关模型。
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